Konjungtivitis alahan disebabkan oleh tindak balas imun konjunktivitis yang tidak normal kepada alergen.
Alergen biasa adalah bulu haiwan, hama habuk, habuk, debunga, dan lain-lain, orang alahan boleh muncul selepas bersentuhan dengan mata gatal, peningkatan rembesan, mudah koyak dan sebagainya.